はじめまして。白鳥です。
私もVine3.1でsylpheedを使っています。
sylpheed-1.0.3.tar.bz2をとってきて、コンパイルして使用していますが、
x-faceはちゃんと表示されていますよ。

./configureすると最後に
…
config.status: creating po/POTFILES
config.status: creating po/Makefile

sylpheed 1.0.3

image support : yes (gdk-pixbuf)
GnuPG         : no
JPilot        : no
LDAP          : no
OpenSSL       : no
iconv         : yes
compface      : yes
IPv6          : no

The binary will be installed in /usr/local/bin

Configure finished, type 'make' to build.

と表示されますが、小川さんの環境ではcompfaceのところはyesになっているで
しょうか? 確認してみてください。Vineの場合、faces-develがインストールさ
れていないとcompfaceはyesにならなかったと思います。

そろそろ、Vineのsylpheedのバージョンも1.0.3になると思うのでそちらを入手
するのが手っ取り早いでしょうね。