中島と申します。

以前に私も同じような経験をしたので投稿させていただきます。
私の環境はSolaris9 + ATOK12 + Sylpheed0.8.5です。

私の場合はこのほかにも、gaim, gipmsg, gedit等の
GTKを利用したソフトウェアをCDE上で使用した場合に
同様の症状が発生いたしました。

これは、CDE + ATOK 特有（？）の問題で、GNOMEをデスク
ットップ環境としてして使用するか、Wnn6を使えばこの問
題は発生しませんでした。

私はCDE + ATOK でsylpheedを使う場合には、外部エディタ
としてSolaris付属のdtpadを使用してこの問題を回避しています。

解決策ではないかもしれませんが、参考になれば幸いです。